MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_7

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010672	TGA	3	9	102	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918708
2	NC_010672	GCG	2	6	162	167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918708
3	NC_010672	CCG	2	6	220	225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918708
4	NC_010672	GCC	2	6	241	246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918708
5	NC_010672	GGT	2	6	318	323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918708
6	NC_010672	GAT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918708
7	NC_010672	CAG	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918710
8	NC_010672	GCA	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918710
9	NC_010672	GAGC	2	8	1802	1809	25 %	0 %	50 %	25 %	187918710
10	NC_010672	TGT	2	6	1978	1983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918705
11	NC_010672	T	6	6	2002	2007	0 %	100 %	0 %	0 %	187918705
12	NC_010672	TGGT	2	8	2015	2022	0 %	50 %	50 %	0 %	187918705
13	NC_010672	TCAG	2	8	2045	2052	25 %	25 %	25 %	25 %	187918705
14	NC_010672	GT	3	6	2104	2109	0 %	50 %	50 %	0 %	187918704
15	NC_010672	TTG	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918704
16	NC_010672	TCT	2	6	2188	2193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187918704
17	NC_010672	A	7	7	2211	2217	100 %	0 %	0 %	0 %	187918704
18	NC_010672	CTGG	2	8	2234	2241	0 %	25 %	50 %	25 %	187918704
19	NC_010672	GGT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918706
20	NC_010672	TTG	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918706
21	NC_010672	CTG	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918706
22	NC_010672	CAGC	2	8	2460	2467	25 %	0 %	25 %	50 %	187918709
23	NC_010672	T	6	6	2476	2481	0 %	100 %	0 %	0 %	187918709
24	NC_010672	TGC	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918709
25	NC_010672	CTG	2	6	2566	2571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918709
26	NC_010672	TGC	2	6	2579	2584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918709
27	NC_010672	A	6	6	2645	2650	100 %	0 %	0 %	0 %	187918709
28	NC_010672	CAT	2	6	2656	2661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918709
29	NC_010672	TGT	2	6	2738	2743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918709
30	NC_010672	GTTT	2	8	2811	2818	0 %	75 %	25 %	0 %	187918709
31	NC_010672	CCTG	2	8	2966	2973	0 %	25 %	25 %	50 %	187918707
32	NC_010672	CTGGCG	2	12	3015	3026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187918707
33	NC_010672	TCTG	2	8	3106	3113	0 %	50 %	25 %	25 %	187918707
34	NC_010672	TTC	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187918707
35	NC_010672	GC	3	6	3256	3261	0 %	0 %	50 %	50 %	187918707
36	NC_010672	GT	3	6	3317	3322	0 %	50 %	50 %	0 %	187918707
37	NC_010672	GCCAT	2	10	3323	3332	20 %	20 %	20 %	40 %	187918707
38	NC_010672	CTTT	2	8	5500	5507	0 %	75 %	0 %	25 %	187918711
39	NC_010672	TA	3	6	5516	5521	50 %	50 %	0 %	0 %	187918711
40	NC_010672	GAA	2	6	5556	5561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187918711
41	NC_010672	AAT	2	6	5567	5572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918711
42	NC_010672	A	8	8	5584	5591	100 %	0 %	0 %	0 %	187918711
43	NC_010672	TAA	2	6	5592	5597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918711
44	NC_010672	CATC	2	8	5616	5623	25 %	25 %	0 %	50 %	187918711
45	NC_010672	TCCT	2	8	5630	5637	0 %	50 %	0 %	50 %	187918711
46	NC_010672	GAA	2	6	5667	5672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187918711
47	NC_010672	A	6	6	5681	5686	100 %	0 %	0 %	0 %	187918711
48	NC_010672	ATAA	2	8	5688	5695	75 %	25 %	0 %	0 %	187918711
49	NC_010672	TAT	2	6	5871	5876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187918711
50	NC_010672	ATG	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918711
51	NC_010672	AAT	2	6	5934	5939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918711
52	NC_010672	AAAG	2	8	5940	5947	75 %	0 %	25 %	0 %	187918711
53	NC_010672	TGT	2	6	5981	5986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918711
54	NC_010672	TGTT	2	8	5992	5999	0 %	75 %	25 %	0 %	187918711
55	NC_010672	G	6	6	6570	6575	0 %	0 %	100 %	0 %	187918712
56	NC_010672	CA	3	6	6582	6587	50 %	0 %	0 %	50 %	187918712
57	NC_010672	G	6	6	6817	6822	0 %	0 %	100 %	0 %	187918712
58	NC_010672	GCG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918712
59	NC_010672	TTCCTG	2	12	6859	6870	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187918712
60	NC_010672	AGCG	2	8	7289	7296	25 %	0 %	50 %	25 %	187918713

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.